Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo2Q7TSY8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo2Q7TSY8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms