Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp6r1Q7TSI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms