Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctdp1Q7TSG2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdp1Q7TSG2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms