Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap2lQ7TS74 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms