Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Actn1Q7TPR4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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