Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nphp3Q7TNH6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphp3Q7TNH6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms