Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd1l2Q7TN88 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms