Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sys1Q78S06 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sys1Q78S06 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sys1Q78S06 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sys1Q78S06 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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