Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Eci3Q78JN3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eci3Q78JN3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms