Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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