Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncapd3Q6ZQK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncapd3Q6ZQK0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms