Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nup188Q6ZQH8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup188Q6ZQH8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms