Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Larp1Q6ZQ58 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Larp1Q6ZQ58 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms