Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms