Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NinlQ6ZQ12 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NinlQ6ZQ12 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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