Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chsy1Q6ZQ11 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chsy1Q6ZQ11 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms