Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf653Q6YND2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms