Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc44a1Q6X893 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms