Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rhox8Q6VSS7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rhox8Q6VSS7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rhox8Q6VSS7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms