Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms