Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gja6Q6S5G4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gja6Q6S5G4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms