Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc154Q6RUT8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc154Q6RUT8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms