Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpeQ6RT24 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms