Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bnip1Q6QD59 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bnip1Q6QD59 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bnip1Q6QD59 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bnip1Q6QD59 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms