Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a1Q6PEM8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms