Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms