Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtifQ6PEE2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtifQ6PEE2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms