Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf1cQ6PDZ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms