Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sarm1Q6PDS3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sarm1Q6PDS3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms