Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vstm2lQ6PDS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms