Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trak1Q6PD31 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms