Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttbk1Q6PCN3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttbk1Q6PCN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms