Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slf2Q6P9P0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf2Q6P9P0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf2Q6P9P0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf2Q6P9P0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf2Q6P9P0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf2Q6P9P0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf2Q6P9P0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf2Q6P9P0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms