Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms