Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Senp6Q6P7W0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Senp6Q6P7W0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms