Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cep135Q6P5D4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep135Q6P5D4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms