Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Frg2f1Q6P3A2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frg2f1Q6P3A2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms