Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Casc4Q6P2L7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Casc4Q6P2L7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms