Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Szrd1Q6NXN1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms