Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Asic1Q6NXK8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Asic1Q6NXK8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms