Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms