Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SphkapQ6NSW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SphkapQ6NSW3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SphkapQ6NSW3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms