Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amer3Q6NS69 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Amer3Q6NS69 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms