Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms