Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cep78Q6IRU7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms