Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud6aQ6IE21 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud6aQ6IE21 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms