Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Carmil1Q6EDY6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Carmil1Q6EDY6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms