Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6DFW0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms