Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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