Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl2Q69ZF8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms